Jonathan Lobert est né le 30 avril 1985 à Metz. Il découvre la voile à Mâcon, sur l'Optimist, puis navigue en Moth Europe, Laser et enfin Finn, classe qu'il adopte en 2007 depuis La Rochelle.
Il décroche la médaille de bronze en Finn aux Jeux olympiques de Londres en 2012, puis termine 14e à Rio en 2016. Vice-champion du monde de Finn en 2015 et 2017, il est aussi champion d'Europe en 2017.
En Class40, il figure à l'équipage de 52 ERDF - Des pieds et des mains lors du Mondial Class40 de La Rochelle 2012, où le bateau termine 10e. Après sa carrière sportive, il devient conférencier et consultant, notamment commentateur de la voile olympique pour les Jeux de Paris 2024.
