Né à Quimper en 1954, Philippe Poupon fait partie des équipiers d'Éric Tabarly sur Pen Duick VI, notamment lors de la Whitbread 1977-1978.
En solitaire, il s'impose dans la Solitaire du Figaro en 1982, 1985 et 1995, après une 3e place en 1980 et une 2e en 1983. Avec les multicoques Fleury Michon, il remporte la Route du Rhum 1986, bat en 1987 le record de la traversée de l'Atlantique nord d'ouest en est (7 j 12 h 49 min) et gagne la Transat anglaise 1988.
Il se tourne ensuite vers le monocoque : il chavire lors du Vendée Globe 1989-1990 sur Fleury Michon X, puis termine 3e du Vendée Globe 1992-1993 sur le même bateau. Il est 2e de la Route du Rhum 1990 en multicoque.
Depuis 2009, il mène avec sa famille des expéditions à bord de Fleur Australe pour sensibiliser à la protection des océans. En 2022, il court la Route du Rhum sur le trimaran Flo, 7e en Rhum Multi, en hommage à Florence Arthaud.